1.税务机关将纳税人纳入重点监控范围，并按照相关规定进行纳税评估，在评估过程中发现其存在隐瞒收入、虚开发票等行为，要求其补缴当期税款与滞纳金，并可按规定对其处以罚款，情节严重的移送稽查；

2.纳税人若有不配合的，按规定纳入重大失信名单并对外公告，同时利用系统核查“受票方”，核查其是否存在善意取得虚开增值税发票、恶意串通等情况，并按照规定进行查处，同时将不配合纳税人直接评定为D纳税人，承担D纳税人后果；

3.对长期零申报且持有发票的纳税人，发票降版降量。同时可以按规定要求纳税人定期前往税务机关对发票的使用进行核查；

4.税务机关通过核查，可以按照相关规定采用成本费用公式核定纳税人收入。

需要注意的是，企业零申报只是暂时的解决办法，但不是长期的解决办法。如果公司没有应税收入，建议仔细考虑是否继续经营，而不想经营的公司必须及时注销，以避免税收风险和信用降级的风险。

如果你想零申报，你还必须按时记账，并按时填写纳税申报单。如果你经常忘记申报，当心被列为“非正常户”。